1926年底，任卓宣返回中国，任职于中国共产党广东区委员会。1927年为湖南区委员会委员时，在长沙领导地下活动。那年冬天被省政府当局逮捕下狱，旋被判处死刑遭到枪决，但幸运的是子弹没有击中要害，于是他死而复生并且遇救，进长沙湘雅医院调养，仍继续指挥共党活动。

因而产生1928年间在长沙、平江、浏阳、醴陵等地所发生的小型暴动事件，于是为省府当局所发现。他在第二次被捕后叛变，在湖南做国民党训练反共干部的政治教官。

在任的自述中曾经提及几件“政治反共、实际反共”的得意之作。其中一件是针对共产党要求停止内战、“联合抗日”的口号，任针锋相对地提出“统一救国”与之相抗衡。

这个口号把“攘外”和“安内”两方面结合起来，既强调要救国，又暗含消除异己的意思，显然比“攘外必先安内”高明得多，也更容易为一般人所接受，所以一经提出，立即产生影响。

不仅如此，任卓宣还时时发表文章，提醒国民党不要一心抗战，忘记“安内”。左翼知识界猛烈批驳叶青的“谬论”，直指他为“托洛斯基派”、“日本警犬、民族败类”，中共有关高层也直接致电蒋介石要求追究叶青等人“破坏统一战线”之罪。

1949年7月，任卓宣被任命为国民党中宣部副部长，旋即又代理部长，他奔驰往来于中国西南部，指导宣传业务，反复讲演反共问题并剖析对时局的看法，以鼓舞士气。

到台之后不久，任卓宣辞去宣传部长的职务，任教于政工干部学校，主持帕米尔书店并出版《政治评论》半月刊，他仍然笔耕不辍，研究三民主义、撰写反共文章。后来结集成的《毛泽东思想批判》一书，就是他为向大陆反共广播而撰写的广播稿。