中国在自主研发的北斗导航系统完成组网以后，将南部海域的大批航标替换为了北斗系统航标，因此使用GPS导航的美国船只也就接收不到来自航标的信号了，自然也无法监视在该海域来往的船只。

同时，风平浪静的海面下隐藏了许多暗礁，可能会影响船只航行，因此在允许船只航行的航道上一般都会有航标进行指路，GPS航标被北斗航标替换后，让美国的船只在南部海域的航行也变得风险大增，有效地阻止了美国的骚扰，对此美国专家也感叹，中国的崛起已经势不可挡了。

随着电子对抗技术的发展，卫星定位导航系统当然也存在被干扰的风险。虽然解放军的导弹已经摆脱了对GPS的依赖，但北斗系统依然有可能遭受电子对抗等综合性攻击，直接影响导弹打击精准度。目前的精确制导武器，一般都是采用GPS（北斗）/INS组合制导，即惯性制导+GPS（北斗）全球定位系统辅助制导。

例如美国的战斧式巡航导弹或JDAM卫星制导炸弹，都是以惯性制导为主，GPS导航为辅。当然如果卫星定位信号被破坏，导弹或炸弹的制导系统也照样能工作，只是作战效率会打一些折扣，精度稍差或可靠性稍差。

中国的北斗卫星导航系统可以在全球覆盖，对美国的GPS来说构成了一定的威胁。我国在打算研制北斗系统的时候，也同时开始研制保护北斗系统的“反卫星导弹”，并在2007年的时候，就成功摧毁了一个轨道高度为963公里的废弃气象卫星的反卫星试验。虽然美国在20世纪60年代初就开始研制这种反卫星导弹了，但是我国如今这种反卫星导弹的技术也已经非常成熟，摧毁外层空间卫星的能力也丝毫不逊色于美国。