同时有美国和俄罗斯两个大国在境内有军事基地，使得吉尔吉斯斯坦在获得对恐怖主义的遏制的同时也有苦难言，毕竟请佛容易送佛难，主权国家境内有别国的军事基地始终不是什么好事，尤其是在美国支持的颜色革命发生后，吉尔吉斯斯坦终于认清了无论送上多少真诚，都不会使美国在意识形态领域对自己另眼相看，最终于2013年通过了废除与美国之间的租用军事基地的协议并于2014年关闭了玛纳斯军事基地。在2016年12月，吉尔吉斯斯坦总统阿坦巴耶夫还称决定在相关协定到期时也要关闭俄罗斯坎特军事基地。

对吉尔吉斯斯坦的这一想法，普京也曾在2017年表示，如果吉尔吉斯斯坦人民认为这一基地没有必要继续存在，那么俄罗斯愿意关闭坎特军事基地。然而随着阿富汗战争即将进入尾声，美军的撤离和塔利班的掌权将成为定局，原本由美军主导的打击该地区恐怖主义组织的模式即将解体，本就是恐怖主义组织重点活动地区的中亚及南亚地区各国都开始准备面对一个由原教旨主义控制的阿富汗，以及由此为土壤孕育出的各种极端组织。吉尔吉斯斯坦也不得不重新考虑关闭坎特军事基地对国内应对“三股势力”冲击的影响，于是在近期，吉尔吉斯斯坦驻俄罗斯大使杰克申库洛夫表示，吉尔吉斯斯坦不排除在本国南部建设第二个俄军事基地以应对来自阿富汗方向的威胁。