不过尽管枭龙战机价廉物美，但是却存在一个比较大的问题：该机自首飞以来，一直使用俄制RD-93发动机作为动力，RD-93发动机是米格-29使用的RD-33发动机的单发版本，由于该发动机相对成熟且成本低廉，因此被作为枭龙战斗机的动力。不过该发动机和枭龙战斗机之间却存在一些难以契合的问题。因为RD-93发动机脱胎于RD-33发动机，由于俄罗斯的航空电子技术相对落后，因此RD-93发动机没有装备用于控制发动机状态的计算机，因此在飞行中，一旦气流变化就很容易发生喘震甚至停车。而枭龙虽然是歼-7战斗机的升级版本，但是由于其是依照四代战斗机的技术研制生产，因此具备极高的飞行敏捷性，在飞行中，飞机进气道气流随着飞机的机动动作会有很大变化，由于进气不稳定，RD-93发动机特别容易由于进气量不足导致喘震和熄火。2016年时有一架枭龙战斗机在阿拉伯海上空失事坠毁，推测就是因为发动机的问题导致，后来证实是巴基斯坦飞行员重挂时以超出设计的过载飞行，导致解体。

实际上我国很早就研制了专门为枭龙战斗机配套的WS-13型发动机，在2018年珠海航展上还展示了其改进型WS-13B型发动机，不过由于这款发动机是全新研制，因此采购成本高昂，这对于财政拮据的巴基斯坦而言，负担还是太重，所以在目前情况下，巴基斯坦还是会继续使用安装了RD-93发动机的枭龙战斗机，也许以后会枭龙会换装"中国心"，不过那会是很久以后的事情了。