B61-12核弹虽然和B61-11一样属于钻地核弹，却没有沿用B61-11的固定当量设计，而是采用可调式当量，拥有300吨TNT、5000吨TNT、1万吨TNT和5万吨TNT四种爆炸当量。并拥有不弱于B61-11的钻地能力，让 B61-12 在给定爆炸当量情况下，可以更为有效地杀伤地下深埋目标。

美国科学院曾对核钻地弹不同爆炸高度和钻地深度的等效爆炸当量进行过研究，结果显示核钻地弹地上爆炸的大部分爆炸能量会被地面反弹，对地下目标的杀伤有限。对于深埋、硬目标而言，要达到相同杀伤效果，在地面下数米爆炸可以使爆炸当量的要求减少15~25 倍。对于 B61-12 的爆炸当量而言，其最佳穿透深度约 5米左右，根据撞击试验估计，B61-12 核炸弹可轻松摧毁加固式洲际导弹发射井。

精度更高，更致命

与之前的型号相比，B61-12最大的改动是取消了原型的降落伞，改为加装洛马公司、雷神公司和波音公司联合设计的新型“制导尾翼工具包组件”，可以在下落过程中通过制导组件上的自旋火箭发动机来保持稳定性，并通过制导尾翼调节姿态和轨迹，让B61-12不再是自由落体，而是可以进行一定的控制飞行，在增加射程的同时，大大提高了命中率，圆概率误差从上百米一下子降低到了30米，考虑到B61-12的爆炸当量，这完全称得上是定点打击了。