过运河前，所有船舶需要到达锚地之后，排队办理过运河相关手续，包括向苏伊士运河管理局提供全体船员证件、船舶搭载的货物、船舶油料状况和搭载的危险品货物等级等，以确定船舶通过运河的先后顺序，埃及方面安保检查人员也会登船检查。对需要过运河的船只有一些特殊的要求，例如配备苏伊士运河灯。各国船舶过运河的费用可以多种方式结算。既可以现交过路费，也可以买长期票。一些船多的大型国际海运公司一般都是长期记账结算。军舰和其他外国公务船过运河则是政F之间记账并最终交费。世界第二大运河的巴拿马运河的现状和运行模式基本和苏伊士运河类似。原始的巴拿马运河是当年超级大国为主出资修建的。1914年8月建成，10年工期共花费3.75亿美元，约等于现在的近百亿美元。超级大国收取过河费，从1914年收到了1979年。1979年，巴拿马运河和“运河区”的主权和管理权一起交还巴拿马。

巴拿马方面最近几年又扩建了巴拿马运河，修了新船闸，可以让更大的船舶经过。不过由于航母外飘都太大，仍然不能过河，只能最多通过4万吨级的两攻。由于运量和通过量很大，苏伊士运河一年收入50到60亿美元之间。是埃及在旅游业之外的第二大外汇来源。巴拿马运河的运力稍小，而且因为有船闸，需要拖行机械或者拖轮，因此运行成本也比苏伊士运河稍高。巴拿马运河一年收18到20亿之间。但是巴拿马人口比埃及的上亿人少得多，只有425万人，仅仅运河收入就人均增收500美元。目前人均GDP是1.5万美元以上，在中美洲算是小日子过得还行。巴拿马运河的收费也是雁过拔毛，最小的一笔过河费收入。是来源于一名游泳爱好者，此人在1928年游完巴拿马82公里全程，交了36美分的过路费。而德国的基尔运河的收费标准比以上两个大运河都低，甚至2020年为了增加通过吸引力，还免除了当年的所有过河费。054A和052C都曾经通过基尔运河。