根据现有信息来看，鹰击-21高超音速反舰弹道导弹与尚未得到证实的KD-21空地弹道导弹在结构布局上有着截然不同。前者采用两级设计，弹体后部为固体火箭发动机，弹体前部则由再入式弹头、电子设备舱、战斗部、雷达设备舱及搜索雷达导引头组成，两者之间使用流线型的级间段相连。鹰击-21采用冷发射方式，导弹先弹射升空再点火。鹰击-21导弹采用两级火箭发动机，较大长径比的双椎体结构，头体分离的机动再入战斗部，带有四片可折叠弹翼。

后者则采用整体设计，没有刻意划分出固体火箭发动机与高超音速音速滑翔体，其中弹体尾部还设有四片弹翼，这一设计与珠海航展上亮相的鹰击-21E高度重合。尽管虽有不同，但两者无一例外都采用了双锥体气动构型，均旨在提高导弹再入后的拉起与末制导能力的基础上，同时又降低了在末端攻击阶段热管理的难度。

另外鹰击-21高超音速反舰弹道导弹之所以会采用双锥体气动构型，还与采用乘波体气动构型的反舰弹道导弹上舰能否发挥作用有关。通过技术手段将后者弹体缩小，以求能够装进055万吨大驱上的通用垂发单元中并非什么难事，但乘波体气动构型是否会对大中型水面作战舰艇造成重创却是无人敢打保票。有一种观点认为采用乘波体的高超音速武器的末端精度和控制能力不足，而且战斗部较小，不太适合精确打击海上移动目标。

反观在尺寸不超过通用垂发单元的直径和长度的限制下，采用双锥体气动构型设计的高超音速反舰弹道导弹，便能得益于相对较大的战斗部空间，可以安装重型战斗部，对大中型水面作战舰艇形成更为出色的杀伤效果。