遭受迫害

1966年“文化大革命”开始后，林彪便利用职权直接迫害傅连璋将军：殴打、游斗、抄家。林彪死党邱会作一伙组织人批斗他所谓的“三反言论”，给年逾古稀的傅连璋将军戴上了“三反分子”、“修正主义分子”帽子，说“傅连璋反对毛主席和林副主席”、“在林彪副统帅患病时，不给药吃，还威胁、陷害林副统帅，手段何其毒也！”紧接着傅连璋的家被抄。在军委卫生部机关和宿舍大院内，揭露他“罪行”的大字报更是铺天盖地。1968年3月14日清晨，邱会作根据林彪“把他抓起来”的旨意，在京西宾馆坐镇指挥，将傅连璋将军和妻子陈真仁秘密逮捕，关入秦城监狱。

他被单独押入201监区16室，囚号6847（囚号是林彪、“四人帮”为被他们迫害的高级干部们编的代号，即1968年被关入秦城监狱的第47位高级干部）。

他的夫人陈真仁则被关入另一间囚室。无休止的审讯逼供，让他交待“罪行”，他坚决抗拒，并说，“我的情况毛主席了解，你们去问他”。生活上的折磨很快就摧残了他的身体，他的体质本来就虚弱多病，管理人员却奉命只给他凉窝窝头和萝卜白菜，他只能喝几口菜汤。由于在审讯时他“拒不交待问题”，因此被打断了3根肋骨。

在文革批斗中被打成“喷气式”

此时傅连璋将军已是74岁高龄，拖着断了3根肋骨的身体，又有胃病，不能吃窝窝头，要求吃稀饭，监管人员不给。3月18日，他敲门要求出去，再次遭到看守人员训斥，当晚被换到33室看押。

作为一个凭人道和医术终生行医的傅连璋，却始终弄不清这到底是为什么？他给毛泽东写了一封信，报告自己的境况。信中写到：“我跟随你几十年，你是最了解我的。几十年来我有什么错误，从来没有人跟我谈过，现在突如其来地说我是三反分子，反革命，到底是怎么回事，我实在弄不明白。就算我样样事都做错了，那么1934年你在于都病危时，我挽救了你生命，总是对的吧？希望你现在也能救我一命。”多么催人泪下的信，多么微薄的希望，多么可怜的请求！