咸丰皇帝驾崩后，年仅6岁的载淳即位，由于同治皇帝年幼，咸丰临终前令八位大臣与慈安、慈禧两宫太后共同辅政。原本这是咸丰帝为了让八位大臣和两宫太后互相制衡，既不让大臣独揽朝政，又防止后宫专政，看似两全其美的一个安排，却被野心勃勃的慈禧拉拢慈安太后发动“辛酉政变”瞬间改变了互相平衡的政治关系，至此两宫太后开始垂帘听政。

一个大智若愚，深谋远虑的女人在慈安、慈禧共同听政期间，一些日常事务由慈禧负责处理，每每遇到朝政大事还是由慈安太后最后定夺。慈安生性节俭，她常以国家正是多事之秋为由驳回了众多大臣上奏修缮圆明园的奏折，晚清中兴汉臣曾国藩、李鸿章、左宗棠就是在慈安的提拔下被朝廷重用，为日后这个风雨飘摇中的国家增添了一丝与西方列强抗争的筹码。

在后世很多人的眼中，慈安是一个生性软弱，在政治上处处听从慈禧的皇太后。其实不然，在她成为中宫皇后的五年里，清王朝正处于内忧外患之中，她时常替这个国家感到深深地忧虑，就在这种忧患中她格外小心谨慎地处理朝中政务。虽然没有慈禧那样对权力的痴迷，但是很多关系朝政命运的重大决定，慈安常常亲力亲为与众位大臣共同商议定夺。

曾经担任过大清朝驻英国大使、近代洋务运动的主要领导人之一的薛福成，在他的《庸庵笔记》中曾这样记录：诛杀陷城失地，临阵逃脱的两江总督何桂清，将骄蹇贪淫的胜保下狱赐死，赏给曾国藩，李鸿章，左宗棠爵位，皆出自慈安之意。

对于年幼的同治帝，慈安比生母慈禧对他更为尽心、疼爱，同治在她面前更加无拘无束，在外人的眼里他们更像是一对亲生母子。在同治帝选后的这个问题上，慈安和慈禧有过很大的分歧，慈安看中了贤良端庄的崇绮之女阿鲁特氏，而慈禧相中了更为年轻俏丽的凤秀之女富察氏，慈安并没有强行决断，而是将选择的权力交给了同治帝。最终皇帝选了慈安看中的阿鲁特氏，这也再一次证明了慈安在同治心中的地位，以及她的眼光和大智若愚的智慧。