多尔衮作为满清政权当时实际上的最高领导人，直到吴三桂来投降前夕都没有入住中原的想法，甚至在李自成败走以后，清朝朝廷里还有相当一部分人觉得抢劫一顿就走是上策。但是在山海关击败李自成以后，多尔衮迅速将满清几乎所有家底搬到了北京，一刻都不停留。从这一刻到福王已经在陪都南京称帝、史可法等人已经集结了数十万军队，清朝政府对南方几乎都没有一点想法，而实际上对于满清政权而言这些流着朱元璋的血的朱明后人才是真正的劲敌，最后清朝也花了十七年功夫才在吴三桂（又是这个家伙）绞死永历帝朱由榔后宣布搞掂南方。

历来史学家对这些都各有各的解释，但是笔者想换个角度，从医学的角度来试着解释这一现象。

明朝末年，在气候学上被称为是“小冰河期”，此时环境气温骤然降低，使得自然经济为主导的中国全国上下收成都不好，经济水平一落千丈，李自成们也就此揭竿而起。但是气候的改变对人类来说是坏事，对于其他生物来说却未必如此，比如细菌。

当时的中华大地不仅饿殍遍野，更恐怖的是瘟疫也来凑热闹。就在崇祯帝的最后几年，疫情一步步地扩大，严重的影响到了军队的战斗力。而在李自成大军围城的农历三月，正是疫情发展的最为迅猛的时候。古代卫生条件本来就差，大军围城使得各种物质交换变得困难，自然疫情在城内就蔓延的更为严重。那些拿鞭子都抽不起来的士兵，实际上是已经身染重病了。（可参看我之前的文章《江湖郎中秒变顶级军医：理念领先世界二百年，甚至帮助抗击非典》）对城内形势缺乏估计的明超高层选择了负隅顽抗，甚至没有把太子送到南京去避难，最终在开打以后只坚持了二十四个钟头不到就投降了，不是因为明军战斗意志不坚定，实在是拿不动刀了。

而李自成来到北京以后，北京城内的疫情之惨大大出乎他的意料，对于他来说只有迅速收集好财物离开北京返回根据地西安才是上上策。所谓大顺军进城后腐化严重、战斗力下滑，很大程度上不是被金钱而腐化，很可能是因为感染疾病所致。而李自成之所以要把大军主力全部带出城，一方面是使军队尽快远离疫区，另一方面也是考虑到一旦战败可以将有生力量带走，否则固守北京，无论是胜是败最终都只有死路一条！

吴三桂勤王时带着所有军属，而且走的非常快也很好解释，因为此时东北也爆发了瘟疫，吴三桂正式要带着这些人全部撤出疫区。李自成要他回去他不回、宁可和李自成主力打一张也是这个道理：回宁远等于回到人间地狱，不如和李自成打还有活路，而李自成军队战斗力又有几何也未可知。