2009年，世界卫生组织运行第55年，发生了一场猪流感。此前不久，世卫组织刚刚修订了自己的工作规则，其中包括六个烈度级别的世界疫情管控方案，最高级是6级。当发生6级疫情时，世卫组织可允许新药物新疫苗直接投入使用。理由是“救人要紧”。按常规新药的试验全过程很长，实验也不会100%成功，总会有失败的时候用。

世卫宣布的第一次6级流行病是2009年猪流感。

猪流感历时一年，但是现在看疫情的规模和烈度，充其量是一场流感。在美国确诊病例4000-8000万人，死亡数估计是8868~18306人，取值12，469人，死亡率0.02%。在中国，确诊人数12.3万人，死亡 714例，死亡率0.6%。事实表明猪流感只是一种流感而不能算瘟疫。世卫组织为它发布了六级警报，世界各国必须服从世卫的决定，大量动用本国资源进行抗疫，每个政府都要按天报告国内疫情，对确诊病例进行隔离治疗。因为症状太轻微，以至于管理措施大都流于形式。

世卫组织就这样用机构规则把一个只有指导职能的国际机构凌驾在所有的主权国家之上。

世卫组织这样处置2009年流感，招致了严重的批评。这是很多人不知道的一件事：世卫组织被起诉滥用职权。猪流感发生的当年底，2009-12-26，欧洲议会卫生委员会全票通过一项决议，要求清查制药业巨头在背后对发动“猪流感”全球项目所施加的影响，特别是对WHO施加的影响。该委员会认为，所谓猪流感“大流行病”是“最大的世纪医药丑闻”。决议中说：“制药公司为了推广它们治疗感冒的专利药品和疫苗，向负责公共卫生的科学家和政府官员施加影响，向全世界的政府发出警报，迫使它们把有限的医药卫生资源浪费在无效的疫苗上，把千百万健康的人们暴露在无人知晓的疫苗副作用的风险面前。那些疫苗未经充分检验，而且这样做毫无必要。欧洲议会卫生委员会特别指出，WHO对此前2005-06年的‘禽流感’和2009年的‘猪流感’一起应对失当，“已经造成的伤害是巨大的，不仅涉及由于接种疫苗而致病的人，不仅浪费了公共卫生资金，还破坏了重要的国际卫生机构的公信度”。