但实际上情况比肯尼迪和军方的估算还要糟糕，无论是肯尼迪还是美国军方都高估了自己的实力，他们都认为摧毁苏联本土的导弹发射基地，甚至是毁灭整个苏联在技术上问题并不大，最多也就是有一些漏网之鱼。而实际上，当时美国部署的弹道导弹的射程并没有能力覆盖整个苏联本土地区，美国军方装备的轰炸机也没有足够能力突破苏联本土的防空核导弹的阻击。

如果美国发动对苏联的核打击，只能摧毁苏联部分地区，与此同时一定会招来苏联的全力反击，那么美国阿拉斯加，甚至是本土一带都有可能在这场反击中付出惨重的伤亡。

所以，对苏联的攻击是杀敌一千自损八百的行为，这个时候如果局势升级，美苏之间的核战争将会不可避免地爆发，而且会两败俱伤。

此时由于美国军方过于自信，他们甚至有绕过肯尼迪直接发动对苏联核打击的想法。因为，美国军方掌握的核武器没有密码，完全有能力绕过总统自行决断。

而在苏联这一方面，赫鲁晓夫及其幕僚非常清楚，如果在古巴地区成功部署了核导弹，确实有能力发动对美国本土的毁灭性打击，但古巴已经被美国人围得像铁桶一般，在古巴的行动骑虎难下了。

面对美国对苏联的战争欲望越来越强烈，美国有没有能力彻底打败苏联，会不会发动对苏联的先发制人的核打击？赫鲁晓夫心里没底儿。

期间，在古巴附近海域装载有核鱼雷的4艘苏联常规动力攻击潜艇已经在美军的压力之下被迫浮上水面，阿拉斯加地区的B52轰炸机携带核炸弹正在空中轮流值班，准备随时攻打苏联的西伯利亚地区。

这一幕幕不得不让赫鲁晓夫心生担忧。

于是在危机的最高峰苏联向美国发出两封信。

第1封信展现了试图谈判的意愿，只要美国人答应不入侵古巴，苏联愿意从古巴将导弹撤回；第2封信相对来说更加强硬，除了第1封信相关的内容之外又加了一条，美国人必须把部署在意大利和土耳其的中程导弹撤走。

美国政府故意忽略了第2封信，回复了关于第1封信的内容，表示可以保证古巴的安全。同时，肯尼迪派出他的弟弟作为特使，和苏联代表进行谈判。这里就凸显了打仗亲兄弟，上阵父子兵的重要性了，也只有肯尼迪的弟弟有资格代表肯尼迪去和苏联人做谈判。