这场万人签名运动引起了社会的剧烈反响，同时也为李公朴招来了杀身之祸。时任国民党云南警备司令部长官的霍揆彰，按照蒋介石的授意，很快拟订了一份逮捕、暗杀民盟负责人的名单。其中，李公朴名列第一位。紧接着，霍揆彰便召集手下的稽查处处长王子民、谍报队长陈国华等人，指示他们对李公朴实施暗杀行动。

不久之后，稽查处处长王子民、谍报队长陈国华，又找来了当时担任国民党预备第二师谍报组上校组长的蔡云旗，以及特务队队员汤时亮、李文山、吴传云等人，商量部署如何暗杀李公朴。为了暗杀成功，这伙刽子手还专门成立了一个暗杀行动小组，蔡云旗还被任命为小组长。

后来，蔡云旗率领汤时亮、李文山、吴传云等人，对李公朴进行秘密跟踪和监视，以便掌握李公朴的行踪，并找到合适的下手机会。1946年7月11日晚上，李公朴与夫人张曼筠到昆明大戏院看电影。电影散场之后，李公朴和夫人张曼筠又乘坐公交车准备回家休息。

然而，让李公朴没有想到的是，就在他和夫人张曼筠走上公交车之后，悄悄跟踪他们的刽子手蔡云旗，就指使特务汤时亮、吴传云也尾随上了公交车。不一会儿，公交车停靠在了站台边上。车门打开之后，特务汤时亮、吴传云假装要下车，当他们走到李公朴旁边的时候，突然掏出手枪向李公朴射击。

随着枪声的响起，公交车上的人顿时乱作一团，特务汤时亮、吴传云乘机下车逃窜，很快消失得无影无踪。眼看丈夫李公朴中弹，张曼筠和热心群众急忙把李公朴送到医院救治。可是，由于伤势过重，李公朴最终因治疗无效，于第二天的凌晨在医院去世，年仅44岁。