1980年6月16日，彭加木探险队一行人走到了库木库附近的时候，因为水源不足而被迫停留下来。在此危急情况下，当然是保住性命要紧，于是经过多人的商讨决定，必须向指挥部求救。可此时，彭加木教授似乎有些不甘心，因为指挥部急救需要耗费人力物力，更重要的是如果就这样被指挥部救回去，那么这次的探索也就戛然而止了。

彭加木拿出背包里的地图，他发现在他们停留的地方附近似乎还有几处水源，他拿出一张纸条在上面写下“我往东去找水井”之后，独自一人离开了。等到同行的探险队员发现这张纸条时，已经是17日下午1点了，而字条上的落款是17日上午10：30，也就是说，彭加木教授已经有将近三个小时不见踪影了。

同行的队员们觉得大事不妙，立即向指挥部报告了这一情况，当地的指挥部联合政府展开了多次的搜救工作。遗憾的是，搜救直升机已经在罗布泊附近寻找了多次，也没有见到彭加木的任何踪迹。从那以后，便再无彭加木教授的音讯。

彭加木教授失踪，科考队搜寻未果

彭加木教授的失踪至今为止仍然是一个未解之谜，尽管科考队多次在罗布泊发现过白骨，但经过DNA的化验表明与彭加木并没有联系。彭加木教授的活不见人死不见尸，为罗布泊的未知与神秘又蒙上了一层恐怖的面纱。此件事也引来了众多人的各种猜测，人们对此议论纷纷。