关于珍妃被杀之事，颇多记述，一般传说由内监总管李莲英奉命执行。动手行凶的是二总管崔玉贵。

当时城外枪炮声隐隐传来，宫中人心惶惶。慈禧太后在忙乱中传话处死珍妃，一时间左右太监面面相觑，不敢前往。只有崔玉贵攘臂而出，口说：“都是怂小子，看我去。”

随后，崔玉贵凶神附体似的进入幽禁珍妃的院落，把珍妃连推带提拥到井口。珍妃跪地求见老佛爷一面，崔厉声说：“没有那些说的。”一脚把珍妃踢入井中，还投下了几块大石头。

这是关于珍妃之死具体情形比较权威的记录，而在很多描摹处死珍妃的文字中，慈禧就在现场。

1929年，成立不久的故宫博物院推出了《故宫周刊》，该刊第30期曾出版了“珍妃专号”，也是该刊的唯一一次专刊。

《故宫周刊》的编辑找到了当时在世的太监唐冠卿，按他的描述，有了这样的记载：

少顷，闻珍妃至，请安毕，并祝老祖宗吉祥。后曰：“现在还成话吗？义和团捣乱，洋人进京，怎么办呢？”继语言渐微，哝哝莫辨。忽闻大声曰：“我们娘儿们跳井吧！”妃哭求恩典，且云未犯重大罪名。后曰：“不管有无罪名，难道留我们遭洋人毒手么？你先下去，我也下去。”妃叩首哀恳，旋闻后呼玉桂(崔玉贵)。桂谓妃曰：“请主儿遵旨吧！”妃曰：“汝何亦逼迫我耶？”桂曰：“主儿下去，我还下去呢。”妃怒

曰：“汝不配！”予聆至此，已木立神痴，不知所措。忽闻后疾呼曰：“把她扔下去吧！”遂有挣扭之声，继而砰然一响，想珍妃已堕井矣。斯时，光绪帝居养心殿，尚未之知也。

这个版本中有慈禧和珍妃的直接对面冲突，更富戏剧性，因而在野史和文学作品中流传甚广，虽然多假借不同人物之口说出，但仍能看出是源自唐冠卿之说。只是，这个版本一直因为是一家之言而备受质疑。

且不论那些或真或假的细节描述，故宫贞顺门的那眼井是珍妃的殒命之地，这一点是确凿无疑的。

多数人对珍妃的了解，大概就以投井而死为止。实际上，她死后的事情，像生前一样跌宕。