其次孝哲毅皇后入宫之后，与同治帝夫妻生活幸福，同治帝时常与她待在一起。同治帝只有一个，孝哲毅皇后得到同治帝的宠爱，那么势必就会有其他人受到冷落。慈禧太后中意的皇后人选，凤秀之女入宫之后，封了个慧妃。入宫之后，同治帝并不怎么喜爱她，自然而然的便冷落了她。慈禧太后见孝哲毅皇后得到同治喜爱，而慧妃却被冷落，心里自然不痛快，对孝哲毅皇后的厌恶更深，以至于后来做出了干涉帝后生活的事情。

慈禧太后之所以讨厌孝哲毅皇后，应该还有慈安太后的原因在。慈安太后在的时候，慈禧太后的确事事取得慈安太后的同意才会去做。但这并不代表，慈禧太后真与慈安太后姐妹情深。后宫女人之间，天生就存在着不可调和的矛盾。

否则后来也不会流出，慈安太后是被慈禧太后害死的说法。而孝哲毅皇后是慈安太后钦定的皇后，是堂堂正正从紫禁城正门抬入的皇后，是正室。而慈禧太后是选秀入宫，从低阶嫔妃慢慢升至如今的地位。虽然与慈安太后并尊太后，但东宫太后慈安太后因为正妻的原因，地位远高于慈禧，所以慈禧对于嫡庶想来还是有些计较的。

慈禧太后经常因为一件小事，就处罚孝哲毅皇后。一般情况下，孝哲毅皇后都默默忍受，但有一次慈禧竟让太监掌掴她。掌掴是清朝对女人最具侮辱性的刑罚，一般宫女都不会受这类刑罚。而孝哲毅皇后作为一国之母，竟然要受此刑罚，自然不愿，便说：”臣妾再怎么也是个正宫皇后，没有该掌嘴的理由！“