1956年，邓铁涛得以参加国家早期兴办的4所中医院校之一——广州中医学院工作。此后，便在中医医疗、教学与科研工作60多年，对重症肌无力、冠心病、高血压、中风、慢性胃炎、慢性肝炎、肝硬化、糖尿病、红斑狼疮、硬皮病及危重病的抢救等诸多领域，积累了丰富的研究成果和诊疗经验。他运用伤寒、温病理论防治瘟疫，救治乙脑、流脑、流感等病患，从中总结寒温融合防治瘟疫的理论，至今仍有效指导着防治流行性、传染性、感染性、发热性疾病的临床实践。

最令人敬佩的是，邓铁涛持续钻研中医“五脏相关”理论50多年，利用辩证唯物主义，给中医事业开创了一个全新的领域，而他的研究取得成就最辉煌的时刻恰恰是在毛泽东时代——

1962年11月16日，邓铁涛在《光明日报》“哲学”版上发表了题为《中医五行学说的辩证法因素》一文，指出中医的五行学说主要落实在藏象学说中，脏腑配五行，是经过无数医疗实践提炼出来的。反映了中医把人体的功能归纳为五大系统(五脏)，内外环境都与这五大系统联系起来，并用五行生克关系表达五大系统的互相依存，互相制约的关系，用以解释生理、病理现象，指导诊断、治疗与预防。通过该文，邓铁涛肯定了中医五行学说具有朴素的辩证法因素。

1975年，邓铁涛就其研究心得，又发表了《再论中医五行学说的辩证法因素》，指出：中医五行学说不等同于古代哲学上的五行学说，后世中医的五行学说，也不完全等同于秦汉以前医学的五行学说，它在中医学中有一个发展过程。

它所概括的生克制化关系，实质是脏腑组织器官之间，人与环境之间，体内各个调节系统促进和抑制之间的关系，五行学说指导临床治疗过程，实质是使人体遭到破坏的内稳态恢复正常的过程。从而肯定了五行学说随着医学历史的发展，不断丰富其辩证法因素。进一步指出这一学说值得研究和发扬。

这些成就的取得正是得益于他对马列主义和毛泽东思想的钻研。