仪式结束后，邓小平带着夫人卓琳前往皇宫会见日本天皇裕仁和皇后良子，这也是中国领导人在二战后第一次同天皇会见。

而这次见面的意义也是极其重大的，日本方面非常担心邓小平会当面给天皇难堪，追究天皇在侵华战争中的责任，但谁料整个会面过程却是出奇的轻松愉快，显示出了邓小平的大智慧和中国领导人的宽广胸襟。

当时裕仁天皇首先伸出手同邓小平及夫人卓琳握手，说：“热烈欢迎，能够见到你们，我非常高兴；你在百忙之中不辞辛苦地来到日本，又缔结了日中友好条约，交换了批准书，我非常高兴。”

而邓小平则回答道：“中日友好条约可能会具有出乎我们意料的深远意义，过去的事情就让它过去吧，我们今后要积极向前看，从各个方面建立和发展两国的和平友好关系。”

从中可以看出，邓小平的意思并不是不再追究日方的战争责任，而是希望大家能够将目光放长远，适应新的国际环境。

在上世纪八十年代初期，邓小平就说过这样的话：“中日关系有很多话要说，但概括起来就是一 句话：中日两国人民世世代代友好下去。”这段话反映了邓小平对进一步发展中日关系的期望，也体现了中日双方共同发展中日关系的理想。

邓小平这段颇有“相逢一笑泯恩仇”的话，令天皇深受触动，他甚至撇开了外务省已经拟好的讲话稿，真诚地说道：“在两国悠久的历史中，虽然其间一度发生过不幸的事情，但正如您所说，那都已成为过去了，今后两国要永远和平友好下去。”

毫无疑问，这是一次极具历史性的会面，所以当天的日媒也对此进行了重点报道。日本共同社说：“陛下在首次会见中国领导人时，使用了‘不幸事件’这一措辞，是从天皇的战争责任角度，间接向中国人民表达了谢罪之意。”