后来，就是在这一排木板房里，赵九章发展出了拥有上千成员的地球物理研究所，再后来又分成地球物理、空间物理和大气物理等很多个部门。

赵九章无论是在学生时代，还是在当教授做研究所工作时，从来不存在“下班”的概念。据他的老师叶企孙说，他一辈子都没逛过街。只有在那些特殊的日子里，才被人拉去逛了街。除睡眠外，醒着的时候，他会低头思考，阅读，或者在黑板前运算。

1948年，国民党的败局已定了，所以就通知气象研究所撤去台湾。赵九章和老师竺可桢不同意。朱家骅拍电话催促他们快走，他就回电说：“八年抗日，颠沛流离，实不堪再动。”当时院里的人大多决定不走，赵九章更舍不得他的科研事业，同时也舍不得他的老师和学生们。

赵九章的学生叶笃正说：恩师桃李满天下，他是真正的儒家学者，继承了孔夫子“有教无类的思想”，不拘一格地培养人才。他培养出来的院士与科研工作者如今在中科院的，或者海外的，数量实在难以计算。

赵九章认为：攀登科学的高峰，并不是那几个人的特权。所以他会“爱才如命”，珍惜他的学生。无论学员出身富贵、贫贱，资质高低，他都一视同仁，而他们从来没见过他发脾气。

1951年的时候，赵九章还收了一批工人、司机和只有中学文化的弟子，把他们中一些人培养成了科学家。每一次，当他听到自己的学生取得成绩，或者是有机会可以将学生送出国留学时，他都满眼欣喜。