水下环境带给人巨大的心理压力，当时每个人携带的氧气瓶只能够作业2个小时，他们团队一共有12个人分工这项工作，每个人每天都清理一点点，就这样，他们足足工作了一个月才终于确认完毕：沉箱的内壁和船体的间隙约为0.5米至1米。

有了这个数据以后，人们才能在船底抽出淤泥插入钢梁，万万没想到，海底淤泥的硬度超出了人们的想象，第一根钢梁居然直接被挤歪了，无法贯穿，只能继续改进计划。

直到2007年12月，“南海一号”的沉箱起浮成功，并且在第二年进驻到了“水晶宫”内，这是一个与原来环境相似的水体中，但是比曾经的位置安全许多，紧接着广东省文物局又组织了2次的试掘工作。

至此，在海底沉睡了800年的时光之后，“南海1号”终于再次到了陆地之上，“水晶宫”也成了中国目前唯一的大型水下考古博物馆，南海一号就静静地躺在这里，供旅客“一睹芳容”，见识到宋朝的海船气象。

只是此时因技术问题延迟了文物研究。

2013年11月28日，“南海一号”的全面保护发掘工作才正式启动，当淤泥逐步祛除的时候，过往的旅客也有幸在透明的两侧长廊中，观看南海一号是怎样褪去神秘的面纱的。

这艘船目前残余长度为22.15米，最大船宽约9.9米，这是一艘我国古代三大船型中的“福船”类型，非常漂亮，是中国文化中不可忽略的一枚明珠。

数以万计的器物被发掘了出来，让所有人看到了中国工商百业在宋朝的繁华景象，这就是中华文明的一段历史，不可磨灭。

根据专家考证，在“南海一号”上。满载着金、银、铁、瓷器等生活用品，其中还有类似阿拉伯手抓饭时使用的“喇叭口”瓷盘，甚至还发现了眼镜蛇的骨骸。

专家推测，当时南海一号是准备驶往西亚的商船，船上不仅仅有中国人，而且还住着阿拉伯人和印度商人，眼镜蛇就是他们饲养地宠物。

2014年的初夏，负责发掘的团队突然听闻国务院副总理刘延东要来“南海一号”这里视察。

这本是好消息，但是工地上的众人却有些发愁，因为他们发现这里没什么能拿得出手的大宝贝，结果就在刘延东副总理来这里的前一天，考古人员在在船体前部左舷外侧发现了一个“大宝贝”。

这是一个装满金器的漆木盒，人们至今还记得打开盒子后的兴奋，他们回忆道那是一个口径约15厘米的木盒，打开以后，里面塞满了金器，有很多的金项链、金戒指，甚至还有一片一片的金叶子，奢华地让人沉醉。

2015年1月28日，经过了7年的保护性发掘，现在沉船表面的淤泥、海沙、贝壳等凝结物也被逐层清理，船舱内的超过6万件层层叠叠、密密麻麻的南宋瓷器得以重见天光，展现在世人面前。