1938年春日军逼近武汉，林明卿携全家(长子媳妇、三儿子夫妇、长女、四个孙子和十名工人)南逃，辗转抵达湖南衡阳林湖乡，办了一个简易布厂，生产棉布运往衡阳销售。后来风闻日军又要打过来了，林明卿带领全家辗转到了广西。到柳州的第三天，林陈氏看见路边一位病危的难友，好心喂她几口稀饭，不幸染上霍乱，临死伸出两个指头想见二儿子林彪。逃难路上林彪家人曾看过无声电影，有林彪指挥打仗的镜头，林陈氏百看不厌。

本来一路吃苦就是投奔老二的，却再也见不上了，全家人跪在地上哭作一团，将林陈氏葬在柳州郊外，请人刻了石碑：“抗日将领林彪母亲之墓”。解放后，林彪姐姐林宝珠曾托林庆佛去柳州寻找母亲的墓地，叶群也曾派秘书去柳州郊外找过，都没找到。

跟随林明卿逃难的林彪侄儿林从旭在1973年回忆：“祖母(林陈氏)、伯母安葬后，我们步行逃难。老人小孩走不动，一天只能行走20里。我们一家日晒夜露，夜晚只能睡在公路旁的露天地下。有时，夜晚也要行走。在途中，我们看到很多老百姓的房屋被日本人烧了，到处是死尸。有的尸体腐烂了，没有人掩埋，臭得难闻。我的祖父(林明卿)、父亲看到这些惨状，口里不停地骂日本人。祖父还咬着牙说：‘宁作太平犬，莫作乱离人，育容(指林彪)，你现在在哪里？你要带兵把这些灭绝人性的强盗斩尽杀绝啦！’”

1943年冬，逃难到贵州的林明卿觉得实在没有活路了。现在不是国共合作吗？林彪是赫赫有名的抗战将领，总会救全家老小的，就让三儿子林育菊到独山县城给林彪拍了个电报：“敌伪侵袭，故土沦陷，家人逃难在黔，母病逝，亟盼援救，父。”