赣南“新政”，初显政治手段

1939年3月，南昌沦陷，国民党省政机关南迁。1940年初，蒋经国正式接任江西第四区行政专员兼保安司令。第四区又称赣南，涵盖了整个江西南部的11个县，人口约200万。因为土地贫瘠，加上盗匪横行，民众生活非常贫困落后。蒋经国到任后，立刻有系统地遍访辖区各个角落，对当地情况有了初步认识与掌握，随即展开了“新政”。

蒋经国首先确定以恢复地方治安为第一要务，展开为期一年的“扫荡行动”，除扩编保安队外，还成立了600人的自卫队。据当时报道，当年全境共有541名土匪自首，逮捕盗匪2246名，处死若干重犯，初步安定了地方。随后，蒋经国宣布向烟、赌、娼开战。规定以一年为勒戒期，一年之后，任何人吸食鸦片，一律处以死刑。1941年，蒋经国命令取缔娼妓，裁撤征收妓院税的单位。一年之内，赣南地区妓院销声匿迹。此外，蒋经国还将各种地租一律减免25%，引进“耕者有其田”的政策，在佃农土地上成立示范农场，把荒地分给贫农耕作。两年之内，当地农业生产总量上升20%。种种政策，让蒋经国被当地百姓称为“青天”。

就在蒋经国逐步展示其政治才华、取得一定成绩的时候，国民党内一些人却开始散布“赣州变‘红’了”、“蒋经国要在赣州搞‘赤化’了”等谣言，并传到了重庆，蒋介石更加怀疑儿子在“睡国民党的床，做共产党的梦”。1943年12月，蒋经国被召回重庆，调任“三青团”中央干部学校教育长，赣南“新政”无疾而终。

重回故地，与苏共正式决裂

1945年抗战胜利后，面对东北势力范围的划分及外蒙古独立的棘手问题，国民党与苏联的关系进入了一个微妙阶段。斯大林出于苏联国家利益的考虑，对国民党采取两手共举的策略：一方面，他不放弃施压蒋介石接受苏联在中国的势力范围；另一方面，他又认为中共尚不成气候，苏联需要维持与蒋介石政权的关系。

在此背景下，蒋经国作为国民党内的“知苏派”，出任外交部东北特派员。1945年圣诞节期间，蒋经国只身前往苏联。12月30日与次年1月3日，蒋经国两度与斯大林会谈，试图说服斯大林促成中共与国民党合作、放弃外蒙古独立等，但都被斯大林以托词敷衍过去，并反过来提出了让国民党将美军送出中国的要求。

在后来俄罗斯解密的苏联文件中，记载了蒋经国与斯大林的会谈内容，其中有一段十分精彩的对白：

蒋经国说，……决定在不改变国民政府的结构和法律地位的条件下邀请中国共产党代表参加政府。……蒋介石同意保留16至20个师的共军并保证其安全。但是，既然谈到中国的统一，军队就应该统一，即统一指挥。蒋介石认为，共产党人不应该将自己的武力用于分裂国家。……请斯大林大元帅向中国共产党提出与国民党合作的建议。